Jorge L. Rosas-Trigueros, Rosaura Palma-Orozco, Cecilia Albortante-Morato

Memorias de la Décima Quinta Conferencia Iberoamericana de Complejidad, Informática y Cibernética: CICIC 2025, pp. 108-109 (2025); https://doi.org/10.54808/CICIC2025.01.108

Jorge L. Rosas-Trigueros
Laboratorio Transdisciplinario de Investigación en Sistemas Evolutivos, Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación, Instituto Politécnico Nacional – Escuela Superior de Cómputo, Ciudad de México, México

Rosaura Palma-Orozco
Laboratorio Transdisciplinario de Investigación en Sistemas Evolutivos, Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación, Instituto Politécnico Nacional – Escuela Superior de Cómputo, Ciudad de México, México

Cecilia Albortante-Morato
Laboratorio Transdisciplinario de Investigación en Sistemas Evolutivos, Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación, Instituto Politécnico Nacional – Escuela Superior de Cómputo, Ciudad de México, México

Cite this paper as:
Rosas-Trigueros, J. L., Palma-Orozco, R., Albortante-Morato, C. (2025). Coordinación de Iones en Metaloproteínas para Simulaciones de Dinámica Molecular. En N. Callaos, J. Horne, E. F. Ruiz-Ledesma, B. Sánchez, A. Tremante (Eds.), Memorias de la Décima Quinta Conferencia Iberoamericana de Complejidad, Informática y Cibernética: CICIC 2025, pp. 108-109. International Institute of Informatics and Cybernetics. https://doi.org/10.54808/CICIC2025.01.108

La proteína ABCA1 es fundamental en la homeostasis del colesterol y el transporte de lípidos en el organismo. Facilita la transferencia de colesterol y fosfolípidos a las apolipoproteínas, formando lipoproteínas de alta densidad (HDL). La variante R230C, común en la población mexicana, se asocia con un menor riesgo de enfermedad arterial coronaria prematura. ABCA1 pertenece a los transportadores ABC, que utilizan la hidrólisis de ATP para transportar sustancias a través de la membrana celular. El dominio Walker B, parte del dominio de unión a nucleótidos (NBD), es crucial para la hidrólisis de ATP y la translocación de sustratos. Nuestro laboratorio desarrolló un protocolo para insertar iones Mg⁺² en la estructura de ABCA1 (PDB ID 5XJY), utilizando CHARMM-GUI para construir el sistema en una bicapa lipídica. La simulación con Gromacs mostró que los iones inducen un cambio de conformación, manteniéndose en el sitio de coordinación después de 5 ns. La resolución del problema de coordinación de iones en metaloproteínas nos permitió obtener una estructura de ABCA1 con iones Mg⁺² coordinados en el dominio Walker B, útil para futuras investigaciones.